Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sar1aP36536 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms