Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab23P35288 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab23P35288 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab23P35288 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms