Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2aP34056 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms