Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms