Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms