Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna1P26231 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna1P26231 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms