Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra3P26049 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra3P26049 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms