Protein–RNA interactions for Protein: P25918

Cd19, B-lymphocyte antigen CD19, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd19P25918 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd19P25918 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd19P25918 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd19P25918 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd19P25918 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd19P25918 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd19P25918 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms