Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms