Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prim1P20664 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim1P20664 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms