Protein–RNA interactions for Protein: P18531

Ighv3-6, Ig heavy chain V region 3-6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-6P18531 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-6P18531 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms