Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18529 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18529 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18529 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18529 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18529 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18529 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18529 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18529 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms