Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim30aP15533 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim30aP15533 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms