Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FosbP13346 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FosbP13346 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FosbP13346 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FosbP13346 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FosbP13346 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FosbP13346 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FosbP13346 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FosbP13346 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FosbP13346 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FosbP13346 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FosbP13346 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FosbP13346 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FosbP13346 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FosbP13346 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FosbP13346 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FosbP13346 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FosbP13346 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FosbP13346 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FosbP13346 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FosbP13346 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FosbP13346 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FosbP13346 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FosbP13346 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FosbP13346 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FosbP13346 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FosbP13346 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FosbP13346 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FosbP13346 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FosbP13346 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FosbP13346 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FosbP13346 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FosbP13346 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FosbP13346 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FosbP13346 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FosbP13346 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FosbP13346 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FosbP13346 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FosbP13346 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FosbP13346 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FosbP13346 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FosbP13346 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FosbP13346 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FosbP13346 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FosbP13346 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FosbP13346 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FosbP13346 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FosbP13346 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FosbP13346 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FosbP13346 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FosbP13346 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FosbP13346 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FosbP13346 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms