Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms