Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms