Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa1P09022 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa1P09022 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms