Protein–RNA interactions for Protein: P00687

Amy1, Alpha-amylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy1P00687 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amy1P00687 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amy1P00687 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amy1P00687 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amy1P00687 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms