Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AurkcO88445 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AurkcO88445 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AurkcO88445 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AurkcO88445 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms