Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nid2O88322 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nid2O88322 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nid2O88322 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nid2O88322 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nid2O88322 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nid2O88322 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms