Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfi1bO70237 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms