Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp10O55123 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp10O55123 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp10O55123 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp10O55123 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp10O55123 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp10O55123 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp10O55123 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp10O55123 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp10O55123 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mmp10O55123 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mmp10O55123 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms