Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limk2O54785 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limk2O54785 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limk2O54785 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limk2O54785 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limk2O54785 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limk2O54785 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limk2O54785 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limk2O54785 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limk2O54785 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limk2O54785 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limk2O54785 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms