Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EdaO54693 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EdaO54693 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EdaO54693 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EdaO54693 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EdaO54693 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EdaO54693 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EdaO54693 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EdaO54693 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EdaO54693 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EdaO54693 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EdaO54693 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EdaO54693 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EdaO54693 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EdaO54693 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EdaO54693 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EdaO54693 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EdaO54693 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms