Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms