Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccl25O35903 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ccl25O35903 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ccl25O35903 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl25O35903 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Ccl25O35903 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ccl25O35903 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ccl25O35903 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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