Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npc1O35604 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npc1O35604 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms