Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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Nedd9O35177 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd9O35177 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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Nedd9O35177 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd9O35177 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd9O35177 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd9O35177 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nedd9O35177 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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Nedd9O35177 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Nedd9O35177 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Nedd9O35177 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Nedd9O35177 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nedd9O35177 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Nedd9O35177 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Nedd9O35177 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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Nedd9O35177 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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Nedd9O35177 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Nedd9O35177 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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