Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eftud2O08810 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms