Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp2O08574 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp2O08574 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp2O08574 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp2O08574 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mesp2O08574 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mesp2O08574 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mesp2O08574 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mesp2O08574 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms