Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms