Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3542K7N6U2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3542K7N6U2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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