Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2056J3QQ02 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms