Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccer2J3QPU5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccer2J3QPU5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccer2J3QPU5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms