Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Gm19965J3QNY8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gm19965J3QNY8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gm19965J3QNY8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Gm19965J3QNY8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Gm19965J3QNY8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Gm19965J3QNY8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Gm19965J3QNY8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Gm19965J3QNY8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Gm19965J3QNY8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm19965J3QNY8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm19965J3QNY8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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