Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms