Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrna9G3X8Z7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chrna9G3X8Z7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms