Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28305F6U473 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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