Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm340F6RGI3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms