Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phldb3E9QAF4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms