Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod3E9QA62 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms