Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc74aE9Q9U8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms