Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FancfE9Q5Z5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FancfE9Q5Z5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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