Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9972E9Q053 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms