Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcn1E9PVA8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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