Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
3425401B19RikD3Z1D3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms