Protein–RNA interactions for Protein: D3YV89

Mmp27, Matrix metalloproteinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp27D3YV89 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp27D3YV89 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms