Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm6133B2RY53 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6133B2RY53 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms