Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms