Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Otud4B2RRE7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud4B2RRE7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms